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小分子蛋白的WB該如何?

更新時(shí)間:2025-01-23點(diǎn)擊次數(shù):1327


WBWesternBlot)是一種常用的生物化學(xué)實(shí)驗(yàn)技術(shù),用于檢測(cè)和分析蛋白樣品中特定蛋白質(zhì)的存在和表達(dá)水平。它通過(guò)將樣品中的蛋白質(zhì)分離并轉(zhuǎn)移到膜上,然后使用特定的抗體識(shí)別目標(biāo)蛋白,并通過(guò)化學(xué)或免疫檢測(cè)方法來(lái)可視化這些蛋白質(zhì)。WesternBlot技術(shù)通常包括樣品制備、SDS-PAGE電泳分離、蛋白轉(zhuǎn)印、封閉和抗體檢測(cè)、曝光顯影等步驟。目前WB被廣泛應(yīng)用于生物醫(yī)學(xué)研究中,用于研究蛋白質(zhì)表達(dá)、翻譯后修飾以及蛋白質(zhì)相互作用等。

小分子蛋白的WB該如何?

1.WB流程圖

在日常實(shí)驗(yàn)過(guò)程中,小分子蛋白是非常常見的,小分子蛋白是指待檢測(cè)的蛋白分子量小于20kda,常見的凋亡蛋白如Bcl2、Caspase-3、Bax,自噬相關(guān)蛋白如LC3B等均為小分子蛋白,這類蛋白由于較小的分子量,易受到凝膠網(wǎng)孔的影響在電泳過(guò)程中彌散,導(dǎo)致難以分離和檢測(cè)。因此,為了檢測(cè)到小分子量的蛋白,需要對(duì)實(shí)驗(yàn)步驟進(jìn)行一些優(yōu)化,以提高實(shí)驗(yàn)成功率。

1. 配膠:整體配膠遵循蛋白分子量越小膠濃度越大的原則,對(duì)于小分子蛋白來(lái)說(shuō),分離膠濃度一般為12%-15%,對(duì)于小分子蛋白條帶可以分的更加清晰。同時(shí)在倒膠時(shí)濃縮膠的比例可以適當(dāng)增加到46,使其充分濃縮,后續(xù)電泳過(guò)程中一定程度上可以減少?gòu)浬ⅰ?/span>15-20kda可選擇12%的凝膠;10-15kda可選擇13.5%的凝膠;小于10kda的蛋白用15%的凝膠或者用Tricine-SDS-PAGE凝膠電泳體系。與傳統(tǒng)的Gly-SDS-PAGE相比,Tricine-SDS-PAGE使用三羥甲基氨基甘氨酸(Tricine)代替甘氨酸(Gly),具有更好的小分子蛋白分離效果。

2. 上樣:根據(jù)日常上樣經(jīng)驗(yàn),建議在跑小分子蛋白時(shí)增加1倍上樣量,防止蛋白彌散過(guò)多。選擇marker時(shí),選擇適用于小分子蛋白的marker,后續(xù)敷抗體時(shí)可以更清楚的進(jìn)行裁膜。電泳開始前可用1′loadingbuffer補(bǔ)齊未點(diǎn)樣的膠孔,防止兩邊不齊跑成"字。

1:賽默飛marker示意圖(左:常規(guī)蛋白marker;右:小分子蛋白marker

3. 電泳:濃縮膠部分設(shè)置恒壓70V、30min左右,一般即可濃縮到一條線上之后調(diào)大電壓至110V,至所需蛋白區(qū)域全部分開為止。盡量避免長(zhǎng)時(shí)間低電壓跑膠,易導(dǎo)致蛋白彌散過(guò)多。同時(shí)整個(gè)電泳過(guò)程中注意降溫。

4. 轉(zhuǎn)膜:由于小分子蛋白分子量小,吸附能力弱,因此轉(zhuǎn)膜時(shí)選擇0.22μmPVDF膜,常規(guī)0.45μm膜容易穿透,剩余條件同正常蛋白一般可以滿足條件。

5. 封閉:快速封閉液或脫脂牛奶按正常條件封閉即可。裁膜時(shí)根據(jù)marker上下留出足夠多的空間。

6. 一抗孵育:在保證上述條件的基礎(chǔ)上,一抗是出好結(jié)果的關(guān)鍵一步,若沒(méi)前期實(shí)驗(yàn)經(jīng)驗(yàn),一抗的稀釋比一般按照說(shuō)明書配置,若有前期實(shí)驗(yàn)的經(jīng)驗(yàn),可適當(dāng)進(jìn)行比例調(diào)整,一抗?jié)舛冗^(guò)高最后顯影階段易出現(xiàn)雜帶,過(guò)低則可能看不到條帶。使用1′TBST緩沖液稀釋,4℃孵育過(guò)夜。

7. 后續(xù)二抗比例及孵育時(shí)間、顯影按常規(guī)操作即可。需要注意若抗體不好用或者蛋白難出結(jié)果,在敷完一二抗時(shí)可適當(dāng)延長(zhǎng)洗膜時(shí)間及次數(shù)。

注意事項(xiàng):

1. 轉(zhuǎn)膜時(shí),若蛋白分子量過(guò)小,可適當(dāng)提高甲醇比例(30%左右)改善吸附能力。

2. 跑小分子蛋白時(shí)marker盡量不跑到一張膜上,對(duì)于常見內(nèi)參GAPDHActinTubulin等來(lái)說(shuō),分離膠濃度大上述蛋白區(qū)域一般分不開或分離不完整,易導(dǎo)致內(nèi)參不齊。

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